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5+单细胞+分子对接生信思路,干湿结合的思路,让sci更好发表了!!

2023-08-31 17:51:06 来源:个人图书馆-智汇基因


【资料图】

导语

今天给同学们分享一篇生信文章“Identification of therapeutic targets for osteosarcoma by integrating single-cell RNA sequencing and network pharmacology”,这篇文章于2023年1月6日发表在Front Pharmacol期刊上,影响因子为5.6。

骨肉瘤(OS)是一种恶性肿瘤,主要发生在儿童和青少年身上,占全球原发性骨肿瘤的20%。目前,骨肉瘤的治疗方法主要包括手术、化疗和放疗。然而,目前对骨肉瘤的治疗方法仍然不尽人意,总体5年生存率为65%至70%。因此,迫切需要开发新的骨肉瘤治疗选择。

1.细胞群集的识别和降维分析

通过scRNA-seq分析,鉴定出了21个细胞亚型和八种细胞类型(图1A、B)。八种细胞类型的标记基因表达在不同细胞类型之间存在差异(图1C)。KEGG富集分析显示八种细胞类型的标记基因在富集通路上存在显著的异质性(图1D)。

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教育